自动化立体托盘仓库有多种系统配置，具体取决于仓储容量、存储效率和批量大小。主要有下面三种：
1、单深：这是最常见的配置，其中一台堆垛机总共访问两排货架，每排一个。
2、双深：一堆垛机每侧访问两排货架，共四排。由于该配置比单深位配置具有更高的存储效率，因此用于批量大且存储效率很重要的系统，例如冷藏仓库和制造商成品仓库。
3、双吊：两台吊装在一条过道上，比单深位约1.5倍的存储和检索能力。当需要高容量时使用该系统，例如自动补充拣货架库存，或者当货物长或重且起重机速度无法提高时。
自动仓库带来了显着的好处。但与任何工作设备一样，检查和维护是确保系统在其整个使用寿命期间始终以最高效率运行的关键。易损件的磨损或库存控制计算机中的故障可能导致运输操作延迟。出于这个原因，自动化仓库制造商提供了一个维护菜单，其中包括定期检查和计算机系统维护。
